Vuoden 2009 alussa tapahtuneen kuntaliitoksen myötä Lehtimäen seurakunta yhdistyi Alajärven seurakuntaan. Lehtimäen kaupunginosan asukkaat kuuluvat Alajärven seurakuntaan. Seurakunnan hallinto ja taloudenhoito tapahtuu pääasiassa kaupungin keskustassa Alajärvellä. Lehtimäen alueen työntekijöinä palvelevat oma pappi, kanttori, diakoni, seurakuntamestari, lapsityöntekijä ja lähetyssihteeri.